Koagulační aktivita heparinu:

Heparin jako směs mukopolysacharidů má různou afinitu k AT III. Heparin se váže k AT III malou částí své molekuly, která obsahuje pentasacharidové sekvence. Frakce heparinu, které obsahují tyto pentasacharidové sekvence mají vysokou schopnost se vázat na antitrombin III. Vysokou afinitu k AT III mají frakce heparinu s nízkou molekulární hmotností, pod 6000 daltonů. Aktivita frakcionovaného nízkomolekulárního heparinu (low molecular weight heparin - LMWH) k antitrombinu III je 4x vyšší než je aktivita nefrakcionovaného heparinu, protože LMWH obsahuje více vazebných sekvencí. O účinku heparinu tedy rozhodují velmi malé funkční fragmenty schopné vazby na AT III. Vysokomolekulární či nefrakcionovaný heparin má nízkou afinitu k antitrombinu III a vyvolává tedy i nižší antikoagulační odpověď. Další skutečností je, že fragmenty heparinu o 16 -20 monosacharidových jednotkách, které mají molekulovou hmotnost nižší než 5000 daltonů a obsahují specifické vazebné pentasacharidové sekvence k AT III, nedokážou významně ovlivňovat trombin.